MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 48690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021738	GCA	2	6	279510	279515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655950
5502	NC_021738	TTC	2	6	279530	279535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655950
5503	NC_021738	ACT	2	6	279563	279568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655950
5504	NC_021738	ATA	2	6	279782	279787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655950
5505	NC_021738	TTTA	2	8	279797	279804	25 %	75 %	0 %	0 %	525655950
5506	NC_021738	ATC	2	6	279827	279832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655950
5507	NC_021738	T	6	6	279932	279937	0 %	100 %	0 %	0 %	525655950
5508	NC_021738	T	6	6	279949	279954	0 %	100 %	0 %	0 %	525655950
5509	NC_021738	TCA	2	6	280002	280007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655950
5510	NC_021738	TAA	2	6	280020	280025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655950
5511	NC_021738	TAA	2	6	280085	280090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655950
5512	NC_021738	AAT	2	6	280105	280110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655950
5513	NC_021738	ACCTC	2	10	280155	280164	20 %	20 %	0 %	60 %	525655950
5514	NC_021738	AG	3	6	280253	280258	50 %	0 %	50 %	0 %	525655950
5515	NC_021738	CTG	2	6	280280	280285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655950
5516	NC_021738	GA	3	6	280324	280329	50 %	0 %	50 %	0 %	525655950
5517	NC_021738	TTA	2	6	280332	280337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655950
5518	NC_021738	CTT	2	6	280355	280360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655950
5519	NC_021738	TGC	2	6	280394	280399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655950
5520	NC_021738	AAT	2	6	280419	280424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655950
5521	NC_021738	ATT	2	6	280435	280440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655951
5522	NC_021738	ACG	2	6	280490	280495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655951
5523	NC_021738	A	6	6	280531	280536	100 %	0 %	0 %	0 %	525655951
5524	NC_021738	ACCA	3	12	280545	280556	50 %	0 %	0 %	50 %	525655951
5525	NC_021738	AATC	2	8	280559	280566	50 %	25 %	0 %	25 %	525655951
5526	NC_021738	ATT	2	6	280649	280654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655951
5527	NC_021738	AAT	2	6	280676	280681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655951
5528	NC_021738	TAC	2	6	280734	280739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_021738	ATT	2	6	280741	280746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_021738	TAA	2	6	280751	280756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_021738	CT	4	8	280774	280781	0 %	50 %	0 %	50 %	525655623
5532	NC_021738	CTT	2	6	280924	280929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655623
5533	NC_021738	CCA	2	6	280975	280980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655623
5534	NC_021738	AATT	2	8	281021	281028	50 %	50 %	0 %	0 %	525655623
5535	NC_021738	ATT	2	6	281042	281047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_021738	AATT	2	8	281057	281064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_021738	AAT	2	6	281073	281078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_021738	TAT	2	6	281083	281088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_021738	ATT	2	6	281169	281174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655952
5540	NC_021738	GCT	2	6	281183	281188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655952
5541	NC_021738	ACA	2	6	281216	281221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655952
5542	NC_021738	TGC	2	6	281248	281253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655952
5543	NC_021738	TTC	2	6	281257	281262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
5544	NC_021738	T	6	6	281270	281275	0 %	100 %	0 %	0 %	525655952
5545	NC_021738	TCT	2	6	281369	281374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
5546	NC_021738	CAG	2	6	281382	281387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655952
5547	NC_021738	T	6	6	281488	281493	0 %	100 %	0 %	0 %	525655952
5548	NC_021738	AAC	2	6	281581	281586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655952
5549	NC_021738	TCA	2	6	281597	281602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655952
5550	NC_021738	T	6	6	281605	281610	0 %	100 %	0 %	0 %	525655952
5551	NC_021738	CTT	2	6	281625	281630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
5552	NC_021738	ACC	2	6	281680	281685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655952
5553	NC_021738	TTGAT	2	10	281718	281727	20 %	60 %	20 %	0 %	525655952
5554	NC_021738	ACG	3	9	281815	281823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655952
5555	NC_021738	TTC	2	6	281824	281829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
5556	NC_021738	TTTG	2	8	281896	281903	0 %	75 %	25 %	0 %	525655952
5557	NC_021738	AGTTA	2	10	281974	281983	40 %	40 %	20 %	0 %	525655952
5558	NC_021738	GGT	2	6	282015	282020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655952
5559	NC_021738	TTTGTC	2	12	282082	282093	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525655952
5560	NC_021738	CACTT	2	10	282136	282145	20 %	40 %	0 %	40 %	525655952
5561	NC_021738	TAA	2	6	282184	282189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655952
5562	NC_021738	ACG	2	6	282325	282330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655952
5563	NC_021738	TAC	3	9	282334	282342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655952
5564	NC_021738	GTT	2	6	282343	282348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655952
5565	NC_021738	TTTAC	2	10	282488	282497	20 %	60 %	0 %	20 %	525655952
5566	NC_021738	TTC	2	6	282526	282531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
5567	NC_021738	CAC	2	6	282576	282581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655952
5568	NC_021738	ACT	2	6	282587	282592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655952
5569	NC_021738	TCT	2	6	282608	282613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
5570	NC_021738	AAC	2	6	282625	282630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655952
5571	NC_021738	TCA	2	6	282638	282643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655952
5572	NC_021738	CAGATT	2	12	282699	282710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525655952
5573	NC_021738	CAA	2	6	282723	282728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655952
5574	NC_021738	CAA	2	6	282750	282755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655952
5575	NC_021738	AAC	2	6	282766	282771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655952
5576	NC_021738	GTG	2	6	282783	282788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655952
5577	NC_021738	TTC	2	6	282802	282807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
5578	NC_021738	AGT	2	6	282809	282814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655952
5579	NC_021738	ATA	2	6	282836	282841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655952
5580	NC_021738	TCT	2	6	282844	282849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_021738	CATC	2	8	282860	282867	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_021738	ATA	2	6	282891	282896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_021738	CAA	2	6	282922	282927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_021738	TTC	2	6	283151	283156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655953
5585	NC_021738	CTA	2	6	283245	283250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655953
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5587	NC_021738	TCA	3	9	283440	283448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655953
5588	NC_021738	T	6	6	283460	283465	0 %	100 %	0 %	0 %	525655953
5589	NC_021738	A	6	6	283509	283514	100 %	0 %	0 %	0 %	525655953
5590	NC_021738	CAC	2	6	283564	283569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655953
5591	NC_021738	T	7	7	283594	283600	0 %	100 %	0 %	0 %	525655953
5592	NC_021738	TCA	2	6	283661	283666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655954
5593	NC_021738	GTA	2	6	283688	283693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655954
5594	NC_021738	TTTCA	2	10	283699	283708	20 %	60 %	0 %	20 %	525655954
5595	NC_021738	CAT	2	6	283720	283725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655954
5596	NC_021738	GA	3	6	283734	283739	50 %	0 %	50 %	0 %	525655954
5597	NC_021738	ATTC	2	8	283983	283990	25 %	50 %	0 %	25 %	525655954
5598	NC_021738	CAG	2	6	284034	284039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655954
5599	NC_021738	ATTA	2	8	284041	284048	50 %	50 %	0 %	0 %	525655954
5600	NC_021738	CAC	2	6	284052	284057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655954
5601	NC_021738	TCTG	2	8	284084	284091	0 %	50 %	25 %	25 %	525655954
5602	NC_021738	TAG	2	6	284241	284246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655954
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5604	NC_021738	GTTA	2	8	284380	284387	25 %	50 %	25 %	0 %	525655954
5605	NC_021738	TA	3	6	284472	284477	50 %	50 %	0 %	0 %	525655954
5606	NC_021738	AAT	2	6	284578	284583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655954
5607	NC_021738	ACAA	2	8	284591	284598	75 %	0 %	0 %	25 %	525655954
5608	NC_021738	A	6	6	284613	284618	100 %	0 %	0 %	0 %	525655954
5609	NC_021738	T	7	7	284643	284649	0 %	100 %	0 %	0 %	525655954
5610	NC_021738	ATGT	2	8	284654	284661	25 %	50 %	25 %	0 %	525655954
5611	NC_021738	ACG	2	6	284677	284682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655955
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5613	NC_021738	TTG	2	6	284745	284750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655955
5614	NC_021738	GAA	2	6	284757	284762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655955
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5616	NC_021738	A	7	7	284822	284828	100 %	0 %	0 %	0 %	525655955
5617	NC_021738	TGG	2	6	284889	284894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655955
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5619	NC_021738	ACTTT	2	10	285080	285089	20 %	60 %	0 %	20 %	525655955
5620	NC_021738	GTA	2	6	285143	285148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655955
5621	NC_021738	AACA	2	8	285152	285159	75 %	0 %	0 %	25 %	525655955
5622	NC_021738	TTA	2	6	285193	285198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5624	NC_021738	AGCT	2	8	285242	285249	25 %	25 %	25 %	25 %	525655624
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5996	NC_021738	TCA	2	6	305293	305298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655971
5997	NC_021738	TCA	2	6	305320	305325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655971
5998	NC_021738	T	6	6	305385	305390	0 %	100 %	0 %	0 %	525655971
5999	NC_021738	ATC	2	6	305499	305504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655971
6000	NC_021738	TAAAG	2	10	305513	305522	60 %	20 %	20 %	0 %	525655971

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